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基于 Model Context Protocol (MCP) 的后端服务器实现，聚合多家生物医药数据库的工具与资源，通过 JSON-RPC 与 LLM 客户端通信，提供资源托管、工具注册与执行、提示模板渲染等能力，并支持统一端点与各个 API 的专用端点，面向将来将上下文信息与功能模块化提供给大语言模型进行后端上下文服务。该仓库实现了一个以 FastMCP 为核心、覆盖 Reactome、KEGG、UniProt、Omim、GWAS、PubMed、OpenFDA、MyVariant、BioThings、NCI 等多家 API 的 MCP 服务器集合。

基于 Model Context Protocol (MCP) 的空间转录组分析后端服务器实现，提供资源管理、工具注册与执行、以及可渲染的提示模板，供大语言模型客户端通过 JSON-RPC 进行统一上下文服务与分析任务调用。

用于搜索、访问和下载欧洲核苷酸数据库 (ENA) 中 RNA 测序数据集的 Model Context Protocol (MCP) 服务器，支持按疾病、生物、技术和组织类型进行高级过滤。

连接LLM与Terra.Bio生命科学平台的MCP服务器，通过FISS API提供工作空间管理、基因组数据分析流程监控和数据交互工具。

通过MCP协议为LLM客户端提供Scanpy单细胞RNA测序数据分析能力。

通过MCP协议，为单细胞RNA测序数据提供自然语言界面的CNV分析服务。

通过MCP协议，为单细胞RNA测序分析提供工具和上下文服务。

使AI助手等客户端连接到Galaxy生物信息学平台，提供工具执行、数据管理和工作流集成能力。

为LLM代理提供基因组数据访问、转录调控分析工具调用及高性能计算资源访问能力的MCP服务器。

SCMCP是用于单细胞RNA测序分析的MCP服务器，提供数据IO、预处理、分析和可视化工具。

为 Scanpy 提供自然语言接口的 MCP 服务器，通过自然语言指令驱动 Scanpy 进行单细胞数据分析和可视化。

TakumiY235_uniprot-mcp-server 是一个 MCP 服务器，它通过工具向 LLM 客户端提供访问 UniProt 蛋白质信息（如功能描述、序列等）的能力。

UniProt MCP Server为AI助手提供蛋白质信息查询功能，通过工具调用获取蛋白质的功能描述、序列等信息。