项目简介

Open Targets Platform MCP 服务器是一个基于 Model Context Protocol 的应用程序，专门用于访问 Open Targets Platform 的生物医学数据。该平台包含基因、疾病、药物及其关联关系的全面信息，对药物发现和生物医学研究具有重要意义。

主要功能

GraphQL架构探索：获取完整的GraphQL API架构和详细文档
智能数据查询：执行自定义GraphQL查询获取目标、疾病、药物等数据
批量查询处理：高效执行相同查询的不同参数组合
实体搜索：跨多种类型（基因、疾病、药物、变异体、研究）搜索并标准化标识符
性能优化：可选jq过滤功能，减少数据传输量，提升响应速度

安装步骤

快速启动（推荐）

使用 'uvx' 工具直接运行：

uvx --from git+https://github.com/opentargets/open-targets-platform-mcp otp-mcp

Docker部署

docker pull ghcr.io/opentargets/open-targets-platform-mcp
docker run -d -p 8000:8000 ghcr.io/opentargets/open-targets-platform-mcp

服务器配置

MCP客户端需要配置以下信息来连接服务器：

基础配置：

服务器名称：Open Targets Platform MCP
传输协议：HTTP（默认）或Stdio
HTTP服务器地址：localhost:8000
可选启用jq过滤功能

基本使用方法

服务器采用三步工作流程：

学习查询结构：通过获取GraphQL架构了解API结构
解析标识符：将通用名称转换为标准化ID
执行查询：使用标准化ID构建并执行查询

核心工具：

获取API架构
执行单次查询
执行批量查询
搜索实体

配置示例

对于Claude Desktop等MCP客户端，配置信息如下：

{
  "mcpServers": {
    "open-targets-platform": {
      "command": "uvx",
      "args": ["--from", "git+https://github.com/opentargets/open-targets-platform-mcp", "otp-mcp"]
}

如需启用jq过滤功能，在args中添加 '--jq' 参数。

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